書類上の顧客や金額に応じて、申請フローを自動的に割り当てることはできますか

申し訳ありませんが、書類上の顧客に応じて申請フローを自動的に割り当てることはできません。

一方で、書類の金額に応じて、利用できる申請フローを分けて設定することであれば可能です。

この場合には、申請フローの「金額による条件」を使用することで実現可能です。詳しくは、申請フローのヘルプの「金額による条件」を参照してください。